Studiował w warszawskiej Akademii Sztuk Pięknych, dyplom uczelni uzyskał w 1946 roku. Przeniósł się do Krakowa, gdzie osiadł na stałe. Jego żoną była artystka Zofia Garbaczewska-Pawlikowska.

Artysta posługiwał się przede wszystkim techniką akwareli. Malował widoki miast, głównie Krakowa, pejzaże i zabytki architektury, m.in. drewniane świątynie, takie jak kościół św. Małgorzaty w Dębnie czy cerkiew św. Dymitra w Szczawniku. Prace Wiktora Pawlikowskiego znajdują się m.in. w zbiorach Muzeum Okręgowego w Nowym Sączu.