Związany z warszawskim środowiskiem fotograficznym. Miejsce szczególne w jego twórczości zajmowała fotografia teatralna (dokumentacja spektakli teatralnych i widowisk muzycznych, portretowanie warszawskich aktorów i artystów) oraz fotografia sportowa. Fotografie Franciszka Myszkowskiego znajdują się w zbiorach Biblioteki Jagiellońskiej, Narodowego Archiwum Cyfrowego w Warszawie oraz Instytutu Teatralnego w Warszawie.