Joanna Rajkowska w swojej pracy korzysta z różnorodnych mediów, w tym rzeźby, fotografii, rysunku, filmu i instalacji. Jest także autorką znanych projektów w przestrzeni publicznej. Jej prace zawierają zarówno architektoniczne i geologiczne fantazje, sztuczne wykopaliska archeologiczne, jak i rzeźby podwodne, dymy kadzideł czy geody wypełnione kryształami. Jest artystką wszechstronną, dopasowującą sposób wypowiedzi artystycznej do potrzeb komunikatu. W 2007 roku Rajkowska została laureatką Paszportu Polityki w kategorii sztuki wizualne, a w 2010 roku otrzymała Nagrodę Wielką Fundacji Kultury za swój dorobek artystyczny.