Studiował na Wydziale Sztuk Wizualnych w Mason Gross School of The Arts na Uniwersytecie Rutgers w USA (1995-1997) oraz na Wydziale Rzeźby w Akademii Sztuk Pięknych w Warszawie (1987-1992). Dwukrotnie, w latach 1992 i 1993 uczestniczył w kursie Letniej Międzynarodowej Akademii Sztuk Pięknych w Salzburgu (Austria). Laureat licznych stypendiów i grantów, m.in.: stypendium Ministra Kultury i Dziedzictwa Narodowego (2011); stypendium i rezydencja artystyczna w Edvard-Munch-Haus, Warnemunde, Niemcy (2006); grant Fundacji Kultury (2002); stypendium Fundacji Kościuszkowskiej, Nowy Jork (1995-1997); grant Fundacji Batorego (1995); grant Kulturkontakt Vienna, Austria (1992 i 1993); stypendium Ministerstwa Kultury Landu Brandenburgii w Kunstlerhaus Schloss Wiepersdorf, Niemcy (1992).

Prace Jacka Malinowskiego znajdują się w kolekcjach Muzeum Sztuki w Łodzi, Narodowej Galerii Sztuki Zachęta w Warszawie, Galerii Arsenał w Białymstoku oraz Centrum Sztuki Współczesnej Znaki Czasu w Toruniu.